Sequenziamento NGS
Genomi microbici (WGS)

BMR Genomics offre un  servizio completo di sequenziamento de novo per piccoli genomi.

Il servizio comprende la preparazione delle librerie, il sequenziamento su piattaforma Illumina ed eventualmente assemblaggio ed annotazione in silico.

Cosa facciamo

• • librerie shotgun
  • sequenziamento su piattaforma Illumina Miseq nel formato 300PE
  • controllo di qualità delle reads

Analisi Bioinformatica

• • assemblaggio de novo
  • predizione genica automatica ed annotazione con PROKKA 1.11

Requisiti

• • 1ug di DNA genomico
  • rapporto di Assorbanza 260/280 1.8-2.0
  • DNA non degradato

Contattateci nel caso di campioni complessi o di difficoltà nel raggiungimento dei requisiti richiesti.

Risultati

• • sequenze in formato FASTQ;
  • sequenza dei contig prodotti dall assemblaggio de novo in formato FASTA;
  • coordinate in formato tabulare dei geni predetti;
  • annotazione genica nei formati GFF e GBK (GeneBank)

Informazioni utili da fornire al momento della richiesta di un preventivo

• • Dimensione stimata del genoma (in Mb)
  • Numero di campioni che si desidera sequenziare

Prezzi

Per maggiori informazioni e per conoscere i nostri prezzi e le nostre offerte contattaci all’indirizzo nextgen@bmr-genomics.it, o al numero di telefono  049 0995752