Corso di bioinformatica RNA-Seq edizione 2023
11 - 14 Settembre 2023
BMR Genomics - Padova
La bioinformatica è sempre più necessaria in ambito biologico per poter analizzare in modo efficace e veloce le crescenti quantità di dati disponibili o prodotti in ambito di ricerca.
Nell’ambito della progettualità, gli esperimenti di RNA-Seq sono largamente diffusi sia nel campo della ricerca di base che della diagnostica. Pertanto, cresce la necessità di ottenere una comprensione più approfondita delle tecnologie coinvolte, dal disegno sperimentale fino all’elaborazione dei dati.
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Esegui ora il test per valutare le competenze su sistema Linux richieste per il corso.
Qualora si sia ottenuto un punteggio minore di 8/12 si consiglia di consultare il materiale informativo disponibile al seguente link.
Informazioni utili
Il corso è indirizzato a tutti coloro che nell’ambito dei propri progetti di ricerca devono affrontare problematiche relative all’RNA-Seq, dal sequenziamento all’analisi differenziale.
Contenuti principali del corso:
- Pianificazione di un esperimento di RNA-Seq
- Pre-processing delle reads
- Allineamento e conte
- Analisi differenziale e arricchimenti
Scarica il programma completo
Le lezioni si svolgeranno in 4 giorni da 6h ciascuno, per un totale di 24h. Da Lunedì 11 a Giovedì 14 Settembre 2023, dalle 9.30 alle 12.30 e dalle 13.30 alle 16.30.
Al termine del corso, agli utenti sarà rilasciato un attestato di partecipazione ufficiale.
- Capacità di consultazione di database biologici.
- Conoscenza di base delle principali estensioni utilizzate nei dati biologici: formato fastq, fasta, ecc.
- Comandi base per muoversi all’interno di un ambiente Linux.
- Conoscenza di base delle tecnologie NGS.
- Conoscenza base dei fondamentali del linguaggio R.
Esegui ora il test per valutare le competenze su sistema Linux richieste per il corso.
Qualora si sia ottenuto un punteggio minore di 8/12 si consiglia di consultare il materiale informativo disponibile al seguente link.
Per partecipare al corso è indispensabile un computer dotato di connessione di rete, con almeno 6/8 Gb di RAM, un client SSH (es. PuTTY per i pc Windows, per Linux e MacOS non è richiesto alcun client) ed RStudio. Le lezioni si svolgeranno in presenza presso la nostra sede aziendale.
L’attivazione del corso è vincolata al numero di adesioni.
Dr. Giorgio Malacrida, master di II livello in Genetica, è il responsabile dell’area NGS presso BMR Genomics. Ha collaborato a numerosi progetti, quali costruzione di genomi de novo, trascrittomica o esomi.
Dr. Giuseppe Benvenuto, PhD in Bioscienze – curriculum Genetica e bioinformatica presso l’Università di Padova, su progetto AIRC. In BMR Genomics si occupa principalmente dei progetti di trascrittomica ed analisi statistiche nella fase di interpretazione del dato biologico.
L’iscrizione sarà considerata valida solo dopo aver compilato il seguente form con le istruzioni riportate nello stesso.
Il costo del corso sarà di 599€ a persona. Nella quota di iscrizione sono comprese le pause caffè ed il pranzo, oltre al materiale per lo svolgimento del corso.
Le modalità di pagamento prevedono due possibilità: buono d’ordine o il bonifico bancario anticipati.
NOTA BENE: In caso di richiesta di recesso pervenuta prima del 27/08/2023, BMR Genomics restituirà l’intero importo versato; trascorsa la data indicata, BMR Genomics restituirà il 50 % dell’importo versato. Ad ogni modo, qualora la persona iscritta volesse inviare un sostituto al proprio posto, BMR Genomics non richiederà alcuna penale o quota aggiuntiva d’iscrizione.
Numero max di iscritti: 15
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